Биоинформационный поиск растительных гомологов Ste20-подобных серин/треониновых протеинкиназ

Abstract

Обнаружено 11 растительных гомологов Ste20-подобных протеинкиназ животных и дрожжей. Показано, что ближайшими растительными гомологами Ste20-подобных протеинкиназ являются белки с ранее неизвестной функцией A9RVK0 из мха Physcomitrella patens ssp. patens и A7P2E2 из винограда Vitis vinifera. Ближайшее положение к группе растительных гомологов занимает Ste20-подобная протеинкиназа dst1 из слизевика Dictyostelium discoideum. Предсказана пространственная структура каталитического домена A9RVK0 из P. patens ssp. patens.

Знайдено 11 рослинних гомологів Ste20-подібних протеїнкіназ тварин та дріжджів. Показано, що найближчими рослинними гомологами Ste20-подібних протеїнкіназ являються білки з раніше невідомою функцією A9RVK0 із Physcomitrella patens ssp. patens та A7P2E2 із Vitis vinifera. Найближче положення до групи рослинних гомологів займає Ste20-подібна протеїнкіназа dst1 із Dictyostelium discoideum. Реконструйована просторова структура каталітичного домену A9RVK0 із P. patens ssp. patens.

Eleven plant homologs of animal and yeast Ste20-like protein kinases were identified. It was shown that the nearest plant homologs of the Ste20-like protein kinases are the unknown proteins A9RVK0 from Physcomitrella patens ssp. patens and A7P2E2 from Vitis vinifera. Cladistic analysis showed a protein kinase dst1 from Dictyostelium discoideum as the closest protein to the newly found plant homologs. A predicted spatial structure of the A9RVK0 from P. patens ssp. patens catalytic domain is presented.