Аффинная модификация хроматина алкилирующим производным гексаде- кадезоксириботимидилата

Abstract

Показана специфическая модификация поли (dA) -трактов ДНК в составе хроматина и интактных ядер из эукариотических клеток производным гексадекадезоксириботимидилата, несущего на 5'-конце остаток 4-(N-2-хлорэтил-N-метиламино)бензиламина. Исследована зависимость доступности ДНК в составе хроматина для аффинной модификации от структурно-функциональных особенностей препаратов хроматина.

Показано специфічну модифікацію полі (dA)-трактів ДНК у складі хроматину та інтактних ядер з еукаріотичних клітин похідним гексадекадезоксириботимідилату, що несе на 5'-кінці залишок 4-(N-2-хлоретил-N-метиламіно)бензиламіну. Досліджено залежність доступності ДНК у складі хроматину для афінної модифікації від структурно-функціональних особливостей препаратів хроматину.

Alkylating derivative of hexadecadeoxyribothymidylate bearing 4-(N-2-chloroethyl-N-methylamino) benzylamine residue on its 5'-terminal phosphate was used for affinity modification of complementary poly (A) sequences in chromatin DNA. The DNA reactivity was not influenced by transcription and replication processes. DNA in suspension chromatin fraction and in intact nuclei was more readily alkylated as compared to that from the soluble chromatin fraction. This effect was attributed to higher superhelicity of DNA in intact nuclear DNA-protein structures. Protein-free isolated DNA was by several orders of magnitude less reactive than the chromatin DNA. Reaction of alkylating oligonucleotide derivatives with DNA is the sequence specific process, since it is suppressed by excess of an arbitrary hexadecanucleotide.