С помощью низкотемпературной ИК фурье-спектроскопии матричной изоляции и квантово-химических
расчетов методами DFT и MP2 исследовано конформационное равновесие молекул нуклеозида
2'-дезоксиуридина (dU) в низкотемпературных матрицах Ar и Kr. Установлено, что в низкотемпературных
матрицах доминируют два анти-конформера dU с разными структурами сахарного кольца:
С2'-эндо и С3'-эндо. Основной син-конформер стабилизирован внутримолекулярной водородной
связью O5'H—O2, а С2'-эндо является доминирующей конформацией его дезоксирибозного кольца в
низкотемпературных матрицах Ar и Kr. Продемонстрирована возможность присутствия в матричных
образцах минорных син-конформеров без внутримолекулярной водородной связи O5'H—O2. Обнаружено
влияние матрицы на ориентацию гидроксильной группы O3'H сахарного кольца основного
син-конформера.
За допомогою низькотемпературної ІЧ фур’є-спектроскопії матричної ізоляції та квантовох
імічних розрахунків методами DFT та MP2 досліджено конформаційну рівновагу молекул нуклеозиду
2'-дезоксиуридину (dU) у низькотемпературних матрицях Ar та Kr. Встановлено, що у низькотемпературних
матрицях домінують два анти-конформера dU з різними структурами цукрового кільця:
С2'-ендо та С3'-ендо. Основний син-конформер стабілізовано внутрішньо-молекулярним водневим
зв’язком O5'H—O2, а С2'-ендо є домінуючою конформацією його дезоксирібозного кільця у низькотемпературних
матрицях Ar та Kr. Продемонстровано можливість присутності у матричних зразках
мінорних син-конформерів, які не мають внутрішньо-молекулярного водневого зв’язку O5'H—O2.
Виявлено вплив матриці на орієнтацію гідроксильної групи O3'H цукрового кільця основного синконформера.
The conformational equilibrium of 2'-deoxyuridine
(dU) in the low-temperature matrices of Ar
and Kr was investigated by using FTIR matrix isolation
spectroscopy and quantum chemical calculations
with the DFT and MP2 methods. It is found
that two anti-conformers of dU with different structures
of the sugar ring (С2'-endo and С3'-endo) are
dominated. The main syn-conformer is stabilized
by the intramolecular hydrogen bond O5'H…O2
and has a С2'-endo conformation of the deoxyribose
ring in the inert Ar and Kr matrices. It is demonstrated
that in the low-temperature matrices
there may occur minor minor syn-conformers without
intramolecular hydrogen bond O5'H…O2. The
orientation of hydroxyl group O3'H of the sugar
ring is found to depend on matrix.
