Взаємодія протипухлинного цитокіну ЕМАР II з гамма-циклодекстрином

Abstract

Дослiджено взаємодiю протипухлинного цитокiну ЕМАР II з гамма-циклодекстрином (γ-ЦД). Проведено аналiз експонованостi ароматичних амiнокислотних залишкiв у структурi рекомбiнантного цитокiну ЕМАР II. Встановлено, що γ-ЦД специфiчно зв’язується з ЕМАР II, i найбiльш вiрогiдним сайтом зв’язування є частково експонований залишок Trp128, локалiзований в заглибинi на поверхнi ЕМАР II поряд з функцiонально важливим лiзинбагатим кластером.

Исследовано взаимодействие противоопухолевого цитокина ЕМАР II с гамма-циклодекстрином (γ-ЦД). Проведен анализ экспонированности ароматических аминокислотных остатков в структуре рекомбинантного цитокина ЕМАР II. Установлено, что γ-ЦД специфически связывается с ЕМАР II, причем наиболее вероятным сайтом связывания является частично экспонированный остаток Trp128, локализованный в углублении на поверхности ЕМАР II наряду с функционально важным лизинбогатым кластером.

The interaction of antitumor cytokine EMAP II with gamma-cyclodextrin (γ-CD) is investigated. The exposure of aromatic amino acid residues in the structure of the recombinant cytokine EMAP II has analyzed. It is found that γ-CD binds specifically with EMAP II, the most likely binding site being partially exposed residue Trp128 localized in a recess on the surface of EMAP II along with the functionally important lysine-rich cluster.