Preparation of bifunctional silica polymer support for the synthesis of 3'-labeled oligonucleotides

Abstract

Preparation of a silica polymer support with a linker arm containing protected amino and hydroxy groups is described. O-Benzotriazol-1-yl-N,N,N'‚N'-tetramethyluronium hexafluorophosphate (HBTU) in the presence of 1-hydroxybenzotriazole (HOBT) was used as an efficient activating reagent at several steps of the polymer synthesis. This bifunctional support is suitable for the preparation of 3'-amino-modified oligonucleotides for post-synthetic conjugation, as well as for the direct solid phase synthesis of 3'-labeled oligonucleotides. The fluorescein-modified silica polymer was synthesized.

Описано спосіб отримання полімерного носія на основі силіка­гелю з лінкером, що містить захищені аміно- і гідроксильну групи. В синтезі полімеру використано ефективний активую­чий реагент гексафторфосфат 1-бензотріазолілокси-N',N',N'', N'-тетраметилуронію за присутності І-гідроксибензотріазолу (НОВТ). Такий біфункціональний носій зручний для отри­мання 3'-модифікованих олігонуклеотидів для пост-синтетичної кон'югації та прямого твердофазного синтезу З'- мічених олігонуклеотидів. Синтезовано флуоресцеїн-модифіко­ваний силікагельний полімер.

Описан способ получения силикагельного полимерного носите­ ля с линкером, содержащим защищенные амино- и гидроксильную группы В качестве эффективного активирующего реаген­та на нескольких стадиях синтеза полимера использовали гексафторфосфат І-бензотриазолилокси-N',N',N'',N'-тетраметилурония в присутствии 1-гидроксибензотриазола. Такой бифункциональный носитель удобен для получения З'-амино-модифицированных олигонуклеотидов для пост-синтетиче­ской конъюгации и для прямого твердофазного синтеза З'-ме­ченных олигонуклеотидов. Смнтезирован флуоресцеин-модифицированный силикагельный полимер.