Предсказание вторичной структуры белков

Abstract

В работе рассмотрена проблема предсказания вторичной структуры белков. С помощью анализа ряда методов, относящихся к разным классам (статистические методы, методы сходства последовательностей, физико-химические методы и комбинированные методы), выявлены преимущества и ограничения существующих подходов к предсказанию вторичной структуры белков. Предлагается гипотеза о возможном направлении прогресса в этой области, основанная на выявлении и анализе информационных сайтов белков, разработке логических методов анализа вторичной структуры белков.

Проаналізовано ряд методів, що належать до різних класів (статистичні методи, методи подібності послідовностей, фізико-хімічні методи та комбіновані методи), визначено переваги й обмеження існуючих підходів до передбачення вторинної структури білків. Запропоновано гіпотезу про можливий напрямок прогресу у цій галузі, яка полягає у виявленні та аналізі інформаційних сайтів білків, розробці логічних методів аналізу вторинної структури білків.

The present state of protein secondary structure prediction is discussed. The benefits and limitations of usually used approaches for the protein secondary prediction structure were determined on the base of analysis of various prediction methods (statistical, physico-chemical, combine methods and methods of sequences similarity). The hypothesis on possible progress in this area is proposed. This idea is to reveal and analyze the informative protein sites and to elaborate the logical methods for analysis of protein secondary structure.