Сиквенс к ДНК С-концевой последовательности капсидного белка ВТМ-изолята томата из района радиологического загрязнения

Abstract

Из района с плотностью радиологического загрязнения по Cs137 11 Ku/ км2 выделены из растений томата два идентичных изолята вируса табачной мозаики, получены рекомбинантные плазмиды pTVM7 и pTVM7.5, содержащие кДНК полного провируса и иммуноспецифическую С-концевую последовательность кДНК капсидного белка для одного из выделенных изолятов. Структурные белки полученных вирусов характеризуются довольно высокой – 19 ±1,9 к Да (17,5 к Да для стандартного штамма ВТМ) молекулярной массой по результатам DS-Na – ПААГ электрофореза. Иммуноблот-анализ трипсиновых фрагментов капсидных белков изолятов и выделенного ранее контрольного штамма далемского изолята не выявил отличий в распределении иммуноактивных фрагментов относительно антисыворотки контроля. По сиквенсу к ДНК pTVM7.5 обнаружена консервативная замена остатка серина на треонин в положении 148 для гомологичного района капсидного белка далемского штамма ВТМ, что может свидетельствовать об иммунологической значимости данного района капсидного белка изолята. Предложен возможный механизм опосредованных физиологическими процессами в инфицированном растении появления и сохранения подобной замены.

Із района зі щільністю радіологічного забруднення по Cs13711 Кі/км2 виділено з рослин томата два ідентичних ізоляти вірусу тютюнової мозаїки, отримано рекомбінантні плазміди pTVM7 і PTVM7.5, що містять відповідно кДНК повного провірусу і імуноспецифічну С-кінцеву послідовність кДНК капсидного білка для одного з виділених ізолятів. Структурні білки отриманих вірусів характеризуються досить високою – 19±1,9 кДа (17,5 кДадля стандартногоіитамаВТМ) молекулярною масою за результатами DS-Na – ПААГ електрофорезу. Імуноблот-аналіз трипсинових фрагментів капсидних білків ізолятів і виділеного раніше контрольного ізолята томатного (далемського) штама не виявив відмінностей у розподілі імуноактивних відносно антисироватки контролю фрагментів. Сиквенс кДНКрТУМ7.5 дозволив виявити консервативну заміну залишку серину на треонін у положенні 148 для гомологічного району капсидного білка далемського штама ВТМ, що може свідчити про імунологічну значущість даного району капсидного білка. Запропоновано можливий механізм опосередкованоих фізіологічними процесами в інфікованій рослині появи і збереження такої заміни.

Two identical strains of tomato type TVM have been isolated at region with Cs137 nuclear contamination with apparently 11 Cilkm2 activity and recombinant plasmids (pTVM7, pTVM7.5) with insert of cDNA provirus and cDNA for C-end specific capsid protein region correspondently from one of isolated viruses have been obtained. The capsid proteins of isolated strains has unusually higher 19±1,9 kDa molecular weight than standard TVM strain (17,5 kDa) on SDS-PAAG electrophoresis data. There have not been found differences in distribution of immunoactivity trypsin-digested protein fragments between isolated strains and control strain on immunoblot data analysis with control antiserum. Sequencing analysis of cDNApTVM7.Shaveshowedoutononeconservativeaminoacidreplacementofthreonineinsteadofserine in position 148 with comparison of that standard tomato TVM sequencing, which allow to make consideration about immunologically importance of this capsid protein region TVM. Also discussed possible mechanism of appearence and keeping such type aminoacid replacement as mediated of physiological processes in infected plant.