The polymorphisms of genes involved in DNA methylation in patients with malignancies from West Ukraine

Abstract

Aim. To determine a potential role of single-nucleotide polymorphisms in the genes involved in the DNA methylation process (MTHFR, MTR, TYMS) in the breast cancer risk and risk of leukemia in a case-control study from West Ukraine. Methods. Genotyping of MTHFR 677 C>T, MTR 2756 A>G and TS 3R2R, TS 3RG>C was performed in 60 patients with leukemia, 90 patients with breast cancer and in 100 persons from a control group. The molecular-genetic analysis was performed by Polymerase Chain Reaction and Restriction Fragment Length Polymorphism analysis. A statistical analysis was conducted by Chi-square tests and odds ratio (OR) calculation. Results. We did not observe any significant difference in genotype frequencies of the MTHFR and TYMS polymorphisms between the cases and controls. The MTR 2756AA genotype frequency was significantly higher in the patients with breast cancer vs control (0.67 vs 0.50, p = 0.02) and the difference between the patients with leukemia and the control group was not statistically significant. The increased risk of breast cancer development was associated with the MTR 2756AA genotype (OR = 2.00, CI – 95 %:1.11–3.60) and the MTR 2756A allele (OR = 1.75, CI–95 %:1.08–2.84). Conclusions. Our findings show that West Ukrainian inhabitants carrying at least one MTR 2756A allele have a significantly increased risk of breast cancer.

Мета. Визначити потенційну роль поліморфізму генів MTHFR, MTR та TYMS в розвитку раку молочної залози і лейкемії серед жителів Західної України. Методи. Проведено генотипування поліморфних локусів MTHFR 677C>T, MTR 2756A>G, TYMS 3R2R та TYMS 3RG>C у 60 пацієнтів з лейкемією, 90 пацієнтів з раком молочної залози та в 100 осіб контрольної групи. Молекулярно-генетичний аналіз проводили за допомогою полімеразної ланцюгової реакції та аналізу поліморфізму довжин рестрикційних фрагментів. Статистичний аналіз проведений шляхом розрахунку χ-квадрат та обчислення коефіцієнту відношення шансів (OR). Результати. Вірогідних відмінностей у розподілі генотипів та алелей щодо поліморфних локусів генів MTHFR та TYMS не встановлено. Встановлено вірогідно вищу частоту генотипу MTR 2756AA у групі осіб з раком молочної залози в порівнянні з контролем (0,67 та 0,50, р=0,02), у групі осіб з лейкемією показники не відрізнялися відносно контролю. Вищий ризик розвитку раку молочної залози асоційований з генотипом AA (OR=2,00, CI-95 %:1.11–3.60) та А алелю (OR = 1,75, CI-95 %:1,08–2,84) поліморфного локусу MTR 2756A>G. Висновки. Встановлено, що наявність однієї копії алеля MTR 2756A може підвищувати ризик виникнення раку молочної залози у жителів Західної України.

Цель. Определить потенциальную роль полиморфизма генов MTHFR, MTR и TYMS в развитии рака молочной железы и лейкемии среди жителей Западной Украины. Методы. Проведено генотипирование полиморфных локусов MTHFR 677 C>T, MTR 2756A>G, TYMS 3R2R и TYMS 3RG>C у 60 пациентов с лейкемией, 90 пациентов с раком молочной железы и у 100 человек контрольной группы. Молекулярно-генетический анализ проводили с помощью полимеразной цепной реакции и анализа полиморфизма длин рестрикционных фрагментов. Статистический анализ проведен путем расчета χ-квадрат и вычисления коэффициента отношения шансов (OR). Результаты. Достоверных различий в распределении генотипов и аллелей полиморфных локусов генов MTHFR и TYMS не установлено. Установлено достоверно высокую частоту генотипа MTR 2756AA в группе лиц с раком молочной железы по сравнению с контролем (0,67 и 0,50, р=0,02), в группе лиц с лейкемией показатели не отличалась относительно контроля. Риск развития рака молочной железы, ассоциированный с генотипом AA (OR = 2,00, CI – 95 %:1.11 – 3.60) и А аллея (OR = 1,75, CI-95 %:1,08–2,84) полиморфного локуса MTR 2756 A>G. Выводы. Установлено, что наличие одной копии аллеля MTR 2756 A может повышать риск возникновения рака молочной железы у жителей Западной Украины.