ITPA gene variant may protect against anemia induced during pegylated interferon alfa and ribavirin combination treatment in Ukrainian patients with chronic hepatitis C

Abstract

The aim of this study was to clarify the association between the inosine triphosphate pyrophosphatase (ITPA) gene variants and PEG-IFNα/RBV combination treatment induced anemia in chronic hepatitis C (CHC) Ukrainian patients. The data were collected from 80 CHC patients with HCV genotype 1 infection. All study participants received standard doses of PEG-IFNα and RBV. According to the Hb level changes patients were distributed into: case group—42 patients with combination treatment induced anemia, and control group—38 patients with no signs of anemia. Genotyping for ITPA gene rs1127354 and rs7270101 variants was performed using PCR followed by RFLP assay. Fisher’s exact test was used to estimate the difference in genotype and allelic distribution. Distribution of rs7270101 genotypes was not significantly different between groups of CHC patients with RBV-induced anemia and without it. The frequency of rs1127354 A allele carriers was significantly higher (P < 0.05) in group of CHC patients without anemia (23.7%) comparing to the group of patients with anemia (7.3%). The respective allele frequency in control group (13.2%) was almost 3-fold higher (P < 0.05) comparing to the case group (4.9%). Significant association of ITPA gene rs1127354 with protection against RBV-induced hemolytic anemia was found in Ukrainian patients with CHC infection. Rs1127354 variant may assist as a pharmacogenetic marker in HCV antiviral therapy correction for side effect avoidance.

Целью настоящего исследования было изучить ассоциацию аллельных вариантов гена инозин трифосфат пирофосфатазы (ITPA) с анемией, индуцированной комбинированной терапией пегилированным интерфероном (PEG-IFNα) и рибавирином (RBV) у пациентов из Украины с хроническим гепатитом С (ХГС). Данные собраны у 80 пациентов с ХГС, которые имели первый генотип вируса. Все участники исследования получали стандартные дозы PEG – IFNα и RBV. В соответствии с изменениями уровня гемоглобина пациенты были разделены на исследуемую группу (42 пациента с анемией) и контрольную (38 пациентов без признаков анемии). Ге-нотипирование полиморфных вариантов rs1127354 и rs7270101 гена ITPA проводили с помощью ПЦР с последующим ПДРФ анализом. Распределение генотипов по полиморфному варианту rs7270101 достоверно не отличалось в группе ХГС пациентов с RBV-индуцированной анемией и без нее. Частота носителей аллеля rs1127354 A была выше в группе пациентов c ХГС без анемии (23,7 %) по сравнению с группой пациентов с анемией. Частота соответствующего аллеля в контрольной группе (13,2 %) была выше, чем в группе пациентов с анемией (4,9 %)почти втрое. Найдена достоверная ассоциация полиморфного варианта rs1127354 гена ITPA с протекцией против рибавирин-индуцированной гемолитической анемии у пациентов из Украины с ХГС. Полиморфный вариант rs1127354 может служить фармакогенетическим маркером для коррекции противовирусной терапии гепатита С во избежание побочных эффектов.

Метою даного дослідження було вивчити асоціацію алельних варіантів гена інозин трифосфат пірофосфатази (ITPA) з анемією, індукованою комбінованою терапією пегильованим інтерфероном (PEG-IFNα) і рибавірином (RBV) у пацієнтів з України з хронічним гепатитом С (ХГС). Дані були зібрані у 80 пацієнтів з ХГС, які мали 1-ий генотип вірусу. Всі учасники дослідження отримували стандартні дози PEG-IFNα та RBV. Відповідно до змін рівня гемоглобіну, пацієнти були розподілені на: групу дослідження – 42 пацієнти з анемією, індукованою комбінованою терапією, та контрольну групу – 38 пацієнтів без ознак анемії. Генотипування поліморфних варіантів rs1127354 та rs7270101 гена ITPA проводили за допомогою ПЛР з наступним ПДРФ аналізом. З метою оцінки достовірності відмінностей в розподілі генотипів та алелів використовували точний тест Фішера. Розподіл генотипів за поліморфним варіантом rs7270101 достовірно не відрізнявся в групі ХГС пацієнтів з RBV-індукованою анемією та без неї. Частота носіїв алеля rs1127354 A була достовірно вище (P<0,05) в групі ХГС пацієнтів без анемії (23,7%), порівняно з групою пацієнтів з анемією. Частота відповідного алеля в контрольній групі була також достовірно вищою (P<0,05) та перевищувала таку в групі пацієнтів з анемією(4,9%) майже втричі. Було знайдено достовірну асоціацію поліморного варіанта rs1127354 гена ITPA із захистом проти рибавірин-індукованої гемолітичної анемії у пацієнтів з хронічним гепатитом С з України. Поліморфний варіант rs1127354 може слугувати фармакогенетичних маркером для корекції противірусної терапії гепатиту С з метою уникнення побічних ефектів.