Організація 5S рибосомної ДНК Melitaea trivia

Abstract

В геномі східноєвропейського метелика Melitaea tri-via виявлено два різних варіанти повторюваної одиниці 5S рДНК. Обидва варіанти повторів містять ділянку довжиною 120 п.н., що кодує 5S рРНК, проте характеризуються різною довжиною міжгенних спейсерів – 78 та 125 п.н. відповідно. Рівень подібності між двома варіантами 5S рДНК становить 43,9–45,5 % для послідовності міжгенних спейсерів, тоді як кодуючі послідовності є більш консервативними. У складі міжгенних спейсерів були виявлені мікросателітні послідовності, які імовірно зазнавали ампліфікації впродовж еволюції 5S рДНК.

В геноме восточноевропейской бабочки Melitaea trivia обнаружены два варианта повторяющегося участка 5S рДНК. Оба варианта повторов содержат участки длиной 120 п.н., кодирующие 5S рРНК, при этом они отличаются длиной межгенных спейсеров – 78 и 125 п.н. соответственно. Уровень сходства двух вариантов 5S рДНК составляет 43,9–45,5 % для последовательностей межгенных спейсеров, тогда как кодирующие участки являются более консервативными. В последовательности межгенных спейсеров были обнаружены микросателлитные последовательности, которые, по-видимому, подвергались амплификации на протяжении эволюции 5S рДНК.

Two length variants of 5S rDNA repeated units were detected in the genome of East European butterfly Melitaea trivia. Both repeat variants contain the 5S rRNA coding region of the same length of 120 bp, but possess the intergenic spacer region (IGS) of different size, 78 and 125 bp, respectively. The level of sequence similarity between the two 5S rDNA variants amounts to 43,9– 45,5 % in the IGS, whereas the coding region appears to be more conservative. In the IGS, microsatellite sequence motives were found; amplification of these motives could be involved in the evolution of the 5S rDNA.