Ідентифікація алельних варіантів генів молочної продуктивності великої рогатої худоби за допомогою полімеразної ланцюгової реакції з використанням методу антипраймера

Abstract

Представлено два незалежних підходи щодо проведення полімеразної ланцюгової реакції (ПЛР) в реальному часі для SNP детекції генів каппа-казеїну та ацил-КоА-діацилгліцерол ацилтрансферази I у великої рогатої худоби. Проаналізовано зразки від 296 корів молочних порід української селекції. За геном каппа-казеїну отримано наступні частоти генотипів: АА – 0,58, АВ – 0,34, ВВ – 0,08, а за геном ацил-КоА-діацилгліцерол ацилтрансферази I: АА – 0,7, АК – 0,26, КК – 0,04. Показана висока ефективність антипраймерної методики. Термін проведення антипраймерної ПЛР у реальному часі займає лише 2–2,5 год та дозволяє повністю ідентифікувати невідомий алельний варіант досліджуваних генів.

Представлены два независимых подхода для проведения ПЦР в реальном времени для определения одиночного нуклеотидного полиморфизма при детекции генов каппа-казеина и ацил-Ко-А-диаглицерол ацилтрансферазы I у крупного рогатого скота. Проанализированы образцы от 296 коров молочных пород украинских коров. По гену каппа-казеина получены следующие частоты генотипов: АА – 0,58, АВ – 0,34, ВВ – 0,08, по гену ацил-Ко-А-диаглицерол ацилтрансферазы I: АА – 0,7, АК – 0,26, КК – 0,04. Показана высокая эффективность антипраймерной методики. Время проведения реакции антипраймерной ПЦР составляет всего 2–2,5 ч и позволяет полностью идентифицировать неизвестный аллельный вариант исследуемых генов.

In this work we have demonstrated two independent real-time PCR methods for detection single nucleotide polymorphism (SNP) of genes csn and acyl-CoA: diacylglycerol acyltransferase 1 (dgat) in cattle. We have analyzed 296 samples of milk production cattle of Ukrainian breeding. The genotype frequencies were АА – 0,58, АВ – 0,34, ВВ – 0,08 for csn gene and for dgat gene – АА – 0,7, АК – 0,26, КК – 0,04. High efficiency of so called «anti-primer»