Порівняння капсидних білків українських ізолятів та типового штаму вірусу тютюнової мозаїки після фрагментації трипсином

Abstract

Проведено порівняльний аналіз українських ізолятів (TMVch і TMVsh) та типового штаму (TMV U1) вірусу тютюнової мозаїки методом пептидного картування капсидного білка, гідролізованого трипсином, з подальшим вивченням одержаних фрагментів з використанням гомо- та гетероспецифічних антисироваток. Результати пептидного картування показали відсутність значних відмінностей в пептидних картах досліджуваних білків, за винятком фракції 7, якої не виявлено в профілі елюції капсидного білка TMV U1. Внаслідок аналізу триптичних фракцій кожного капсидного білка за допомогою вірусспецифічних антисироваток знайдено деякі відмінності у реакції антисироваток з низкою фракцій. Встановлено амінокислотну послідовність пептиду з фракції 12 TMVch, яка повністю збігалася з поліпептидною послідовністю капсидного білка TMV UJ у позиціях 72–90, проте відмічено розбіжності в розпізнаванні цього фрагмента антисироватками

Проведен сравнительный анализ украинских изолятов (TMVch и TMVsh) и типичного штамма (TMV VI) вируса табачной мозаики методом пептидного картирования капсидного белка, гидролизованного трисином, с последующим изучением полученных фрагментов с использованием гомо- и гетероспецифических антисывороток. Данные пептидного картирования по­казали отсутствие значительных отличий в пептидных кар­тах исследуемых белков, за исключением фракции 7, которой не выявлено в профиле элюции капсидного белка TMV VI. В результате анализа триптических фракций каждого капсидно­го белка с помощью вирусспецифических антисывороток най­дены некоторые отличия в реакции антисывороток с рядом фракций. Установлена аминокислотная последовательность пептида из фракции 12 TMVch, полностью совпадающая с полипептидной последовательностью капсидного белка TMV VI в позициях 72–90, однако наблюдались отличия при рас­познавании этого фрагмента антисыворотками.

The comparative analysis of tobacco mosaic virus two Ukrainian isolates (TMVch and TMVsh) and common strain (TMV VI) was carried out by means of peptide mapping of capsid protein hydrolyzed by trypsin with the following analysis of tryptic fragments using homo- and heterospecific antisera. Peptide mapping results were not shown significant differences at the peptide maps of investigated proteins with the exception of fraction 7 that was absent at TMV Ul capsid protein elution profile. The analysis of each protein tryptic fractions using virusspecific antisera revealed certain differences at the reactions of antisera with some fractions. The amino acid sequence of peptide from fraction 12 TMVch capsid protein was established. This sequence coincides completely with the polypeptide sequence of TMV Ul capsid protein at the position 72–90, however the recognition of this fragment by antisera was varied.