1M- и 2М-¹Н-ЯМР-исследование самоассоциации дезокситетрарибонуклеозидтрифосфатов различной последовательности оснований в водном растворе

Abstract

Методом ПМР-спектроскопии (500 МГц) изучено равновесие самокомплементарных дезокситетрарибонуклеозидтрифосфатов 5'-d(GpCpGpC), 5'-d(CpGpCpG), 5'-d(ApGpCpT) и 5'-d(ApCpGpT) в водном растворе. Произведено полное отнесение сигналов протонов тетрануклеотидов по измеренным 2M-COSY- и 2M-NOESY-спектрам. Исследованы концентрационные и температурные зависимости протонных химических сдвигов, на основании которых по предложенным моделям рассчитаны равновесные константы и термодинамические параметры самоассоциации молекул.

Методом ПМР-спектроскопії (500 МГц) вивчено рівноважне поводження самокомплементарних дезокситетрарибонуклеозидтрифосфагів 5'-d(GpCpGpC), 5'-d(CpGpCpG), 5'-D(ApGpCpT) та 5'-D(ApCpGpT) у водному розчині. Здійснено повне віднесення сигналів протонів тетрануклеотидів по виміряних 2M-COSY- та 2M-NOESY-cneKTpax. Досліджені концентраційні та температурні залежності протонних хімічних зсувів дезокситетрануклеотидів. Розраховані рівноважні константи самоасоціації та значення протонних зсувів в мономірній і дуплексній формах тетрамірів з використанням моделі двох станів. Запропоновано методику розрахунку та визначено термодинамічні параметри реакції самоасоціації молекул. Проведено порівняльний аналіз розрахованих характеристик для самоасоціації тетрануклеотидів різної послідовності.

Equilibrium behaviour of self-complementary deoxytetranucleoside triphosphates 5'-d(GpCpGpC), 5'-d(CpGpCpG), 5'-d(ApGpCpT) and 5'-d(ApCpGpT) in aqueous solution have been studied by the method of PMR spectroscopy (500 MHz). Assignments of the tetranucleotides protons have been obtained from both two-dimensional homo-nuclear COSY and NOESY experiments. Concentration and temperature dependences of proton chemical shifts have been investigated. Equilibrium association constants and thermodynamical parameters of molecules self-association have been calculated using theoretical models and regression equations based on experimental results.