Взаимодействие акрихина с одноцепочечными полинуклеотидами по данным лазерной поляризованной флюоресценции

Abstract

Методом лазерной поляризованной флюоресценции изучено взаимодействие акридинового красителя акрихина с однонитчатыми полинуклеотидами поли(А) и поли(ІІ) в водных растворах при нейтральном значении рН. При малых отношениях молярных концентраций полимера и красителя P/D и низкой ионной силе доминирует агрегация молекул акрихина, возникающая в результате кооперативного связывания с полианионной матрицей со стэкингом хромофоров. Агрегация характеризуется гипохромизмом спектров поглощения и почти полным тушением флюоресценции. При высоких значениях P/D стопки молекул красителя распадаются и их хромофоры переключаются на стэкинг с кольцами оснований с изменением оптических свойств, характерным для интеркаляции в двойную спираль ДНК. На основе полученных данных с помощью теорий Шварца и Нечипуренко проведен количественный анализ конкуренции двух типов комплексообразования.

Методом лазерної поляризованої флюоресценції вивчено взаємодію акридинового забарвника акрихіну з однонитковими полінуклеотидами полі (А) та полі (U) у водних розчинах з нейтральним значенням рН. При малих співвідношеннях молярних концентрацій полімеру і забарвника (P/D) та низькій іонній силі домінує агрегація молекул акрихіну, що виникає в результаті кооперативного зв'язування з поліаніонною матрицею із стекінгом хромофорів. Агрегація характеризується гіпохромізмом спектрів поглинання і майже повним гасінням флюоресценції. При високих значеннях P/D купки молекул забарвника розпадаються і їх хромофори переключаються на стекінг з кільцями основ із зміною оптичних властивостей, характерною для інтеркаляції у подвійну спіраль ДНК. На основі одержаних даних за допомогою теорій Шварца та Нсчипурепка проведено кількісний аналіз конкуренції двох типів комплексоутворення.

The interaction of quinacrine with single-stranded polynucleotides poly (A) and poly(U) in aqueous soluttions at neutral pH is studied hy the laser polarized fluorescence method. At small polymer-dye ratios, P/D, and low ionic strength guinacrine molecule aggregation, due to cooperative binding to the polyanionic matrix, followed by chromophore stacking, predominates. Aggregation is characterized by hypochromism of the absorption spectra and by almost complete fluorescence quenching. At high P/D values the stacks of dye molecules dissociate, and its chromophores stack with base rings and change its optical properties which is characteristic of intercalation into double-stranded DNA. The quantity analysis of competition of two complex formation types was made using the obtained data and the theories proposed by Schwarz and Nechipurenko.