Подобие ДНК-узнающих структур активатора координированной транскрипции генов, кодирующих ферменты биосинтеза аминокислот у дрожжей, регуляторов дифференцировки клеток дрожжей и регуляторов развития и морфогенеза

Abstract

Методом необходимых стереохимических условий существования ДНК- узнаюшей структуры спираль–изгиб–спираль получена локализация этой структуры в ДНК-узнающем домене белка GCN4 – сегменте 256–278. Обнаружена гомология по аминокислотной последовательности структур спираль–изгиб–спираль белков GCN4, МАТα1 и МАТα2 и гомеодоменсодержащих белков.

Методом створення необхідних стереохімічних умов існування ДНК-розпізнавальної структури спіраль-вигин-спіраль отримано локалізацію цієї структури в ДНК-розпізнавальному домені білка GCN4-сегменті 256–278. Виявлено гомологію за амінокислотною послідовностю структур спіраль-вигин-спіраль білків GCN4, МАТα1 і МАТα2 та гомеодоменвмісних білків.

Basing on the data obtained by the method of necessary stereochemical requirements of the DNA-recognizing structure helix-turn-helix existence and the available data from literature a conclusion is made that 1) GCN4 protein, probably, recognizes DNA using DNA-recognizing structure helix-turn-helix, localized in the amino acid sequence segment 256–278 and 2) DNA-recognizing structure of GCN4 protein is similar to those of MATα1 and MATα2 proteins, and homoeodomain-containing proteins.