Геномика и структура вирионных ДНК умеренных эрвиниофагов 49 и 59

Abstract

Проведено сравнительное изучение вирионной ДНК эрвиниофагов 49 и 59 с применением биоинформатического анализа и стандартной рестрикции. Установлено, что геномы обоих фагов циклически пермутированные, однако пермутация ДНК фага 59 является непрерывной, в то время как у фага 49 она носит дискретный характер. Вирионная ДНК фага 49 имеет аномальный SmaI-сайт, который, в отличие от остальных сайтов для эндонуклеазы SmaI, не подвергается полному гидролизу, что, скорее всего, связано с влиянием ближайшего нуклеотидного окружения.

Здійснено порівняльне дослідження віріонної ДНК ервініофагів 49 і 59 за допомогою біоінформатичного аналізу та стандартної рестрикції. Встановлено, що геноми обох фагів циклічно пермутовані, однак пермутація ДНК фага 59 є неперервною, тоді як у фага 49 вона має дискретний характер. Віріонна ДНК фага 49 має аномальний SmaI-сайт, який не піддається повному гідролізу, що, найімовірніше по'язано з впливом найближчого нуклеотидного оточення.

A comparative study of virion DNAs of phages 49 and 59 by the standard restriction and bioinformatic analyses is conducted. It has been shown that the genomes of both bacteriophages are cyсlically permuted, but phage 59 is characterized by continuous permutation of the genome, while phage 49 has discrete permutation. Virion DNA of phage 49 has an abnormal cleavage site for SmaI restriction enzyme that, unlike the rest SmaIsites, is not completely hydrolyzed.