Наукова електронна бібліотека
періодичних видань НАН України

Докинг низкомолекулярных лигандов на молекуле растительного FtsZ-белка: применение технологии cuda для ускорения расчетов

Репозиторій DSpace/Manakin

Показати простий запис статті

dc.contributor.author Демчук, О.Н.
dc.contributor.author Карпов, П.А.
dc.contributor.author Блюм, Я.Б.
dc.date.accessioned 2017-11-24T16:24:50Z
dc.date.available 2017-11-24T16:24:50Z
dc.date.issued 2012
dc.identifier.citation Докинг низкомолекулярных лигандов на молекуле растительного FtsZ-белка: применение технологии cuda для ускорения расчетов / О.Н. Демчук, П.А. Карпов, Я.Б. Блюм // Цитология и генетика. — 2012. — Т. 46, № 3. — С. 55-64. — Бібліогр.: 54 назв. — рос. uk_UA
dc.identifier.issn 0564-3783
dc.identifier.other DOI: 10.3103/S0095452712030048
dc.identifier.uri http://dspace.nbuv.gov.ua/handle/123456789/126471
dc.description.abstract Приведен обзор и анализ возможностей применения технологии CUDA для ускорения расчетов в области структурной биологии и биоинформатики. На примере работы с программой HEX 6.1 выполнен сравнительный анализ прироста производительности и качества результатов жесткого докинга низкомолекулярных соединений различных классов на поверхности FtsZ белка из Arabidopsis thaliana. Идентифицировано несколько потенциальных сайтов связывания бензимидазолов с растительным FtsZ. uk_UA
dc.description.abstract Наводиться огляд та аналіз можливостей застосування технології CUDA для прискорення обчислень в галузі структурної біології та біоінформатики. На прикладі роботи з програмою Hex 6.1 здійснено порівняльний аналіз приросту продуктивності та якості результатів жорсткого докінгу низькомолекулярних сполук різних класів на поверхні FtsZ-білка із Arabidopsis thaliana. Ідентифіковано декілька потенційних сайтів зв’язування бензімідазолів із рослинним FtsZ. uk_UA
dc.description.abstract The opportunities to apply the CUDA technology for faster computations in structural biology and bioinformatics are reviewed and analyzed. Using HEX 6.1 software, we performed a comparative analysis of the efficiency and the increase in quality after CUDA application. The work was conducted on the example of rigid docking of low-molecular-weight compounds of different classes on the surface of the Arabidopsis thaliana FtsZ. Several potential binding sites of benzimidazoles to the plant FtsZ were identified. uk_UA
dc.language.iso ru uk_UA
dc.publisher Інститут клітинної біології та генетичної інженерії НАН України uk_UA
dc.relation.ispartof Цитология и генетика
dc.subject Оригинальные работы uk_UA
dc.title Докинг низкомолекулярных лигандов на молекуле растительного FtsZ-белка: применение технологии cuda для ускорения расчетов uk_UA
dc.title.alternative Докінг низькомолекулярних лігандів на поверхні рослинного FtsZ білка: застосування технології cuda для прискорення обчислень uk_UA
dc.title.alternative Docking small ligands to molecule of the plant FtsZ protein: Application of the CUDA technology for faster computations uk_UA
dc.type Article uk_UA
dc.status published earlier uk_UA
dc.identifier.udc 577.112.7(577.332+004.42)


Файли у цій статті

Ця стаття з'являється у наступних колекціях

Показати простий запис статті

Пошук


Розширений пошук

Перегляд

Мій обліковий запис