Інститут програмних систем Національної академії наук України був створений у 1992 році постановою Президії Академії наук України від 03 липня № 194 з метою подальшого розвитку фундаментальних та прикладних досліджень, розробок у галузі програмування та їх належного організаційного забезпечення.

Інститут з моменту його створення очолює доктор фізико-математичних наук, лауреат Державної премії України, заслужений діяч науки і техніки України, академік НАН України Андон Пилип Іларіонович.

У цих напрямах ученими Інституту отримано низку наукових результатів високого рівня:

Інститутом розроблено і успішно впроваджено у виробничу, соціальну та оборонну сфери понад 80 великих проектів зі створення новітніх інформаційних технологій і комп'ютерних систем "під ключ" на замовлення органів державного управління – Міноборони України, Держприкордонслужби України, Мінпромполітики України, Міністерства транспорту та зв`язку України тощо.

В Інституті працюють 170 співробітників, з них один академік НАН України, сім докторів наук, двадцять сім кандидатів наук.

В Інституті працюють аспірантура та докторантура з відривом і без відриву від виробництва зі спеціальностей:

Упродовж п’ятнадцяти років закінчили аспірантуру 45 осіб, докторантуру – 6 осіб. Співробітниками Інституту захищені 9 кандидатських та одна докторська дисертація.

Інститут зміцнює зв'язки з вищими навчальними закладами МОН України. Зокрема, Інститут має договори про співпрацю з Національним технічним університетом України "Київський політехнічний інститут" (НТУУ "КПI"), Національним університетом "Києво-Могилянська академія". У 2006 році діяла створена спільно з Національним університетом "Києво-Могилянська академія" кафедра "Мережних технологій".

Співробітниками Інституту читаються лекції у 10 вищих навчальних закладах.

Інститут має угоди про науково-технічне співробітництво з профільними установами Росії, виконує спільні проекти з Угорщиною, США, Грецією, співробітничає з ЮНЕСКО, входить до складу міжнародних асоціацій ІЕЕЕ, АСМ, Асоціації європейських національних спілок дослідження операцій, а також до програмних комітетів низки відомих міжнародних конференцій з програмування, бере активну участь в експертизі проектів стандартів ISO з програмування.

Головним напрямом наукового та науково - технічного співробітництва Інституту з іноземними установами є проведення наукових досліджень з розв’язання науково-технічних проблем у галузі інженерії та технологій програмування, нових інформаційних технологій, баз даних і знань.

Інститут бере активну участь у формуванні та реалізації фундаментальних та прикладних наукових досліджень у галузі програмування, розробки теоретичного, методологічного та інструментально-технологічного базису створення конкурентноспроможного програмного забезпечення, організовує впровадження результатів наукових досягнень у виробничу, соціальну та оборонну сфери, а також формує пропозиції щодо державної політики у галузі індустрії програмування. Біля половини обсягу робіт Інституту складає договірна тематика.

Інститут є координатором з програмування в рамках Національної програми інформатизації та базовою організацією з програми інформатизації НАН України. В рамках Наукової ради з проблеми "Кібернетика" в Інституті працює постійно діючий семінар "Проблеми програмування".

Як установа, що входить до складу Відділення інформатики НАН України, Інститут бере участь у науковій тематиці академії, виконуючи програмно-цільові та конкурсні проекти.

Інститут призначено базовою організацією з стандартизації в Україні у галузі програмної інженерії.

Інститут регулярно видає науковий журнал "Проблеми програмування", головним редактором якого є директор Інституту П.І. Андон.

Інститут здійснює координаційну діяльність з розвитку проблематики програмування через: